BIOVIA Discovery Studio是BIOVIA生命科学和科学建模和仿真科学的主流版本。BIOVIA发现Studio包括程序一样的CHARMM分子力学是非常有效的。经过30多年的精心学术研究,CHARMm的研发工作重点放在研究蛋白质,多肽,小分子配体,核酸,脂质和碳水化合物。对于基于量子的研究,这个应用程序包括DMol3程序。DMol3是一个拥有长期成功商业计划记录的DFT计划。利用其独特的方法来解决量子力学方程,DMol3是可用于计算的最快方法之一,其优点对于具有超过500个原子的较大系统尤其明显。
BIOVIA Discovery Studio的功能和特点:
- 使用CHARMm c41b1进行分子力学(MM)计算
- 支持广泛的电源领域,包括CGenFF,charmm36,charmm27,charmm22,CHARMm,CHARMm-polarH,CFF,MMFF等。
- 完全支持CHARMM分区机制并支持自定义无效定义
- 使用天生的CHARMm溶剂模型(GB)快速准确地电离蛋白质和残余pKs。
- 饮用水的快速溶剂,具有适用于非常大分子系统的可选抗离子
- 根据国标执行任何溶剂明确或最小化溶剂基分子力学(MM)
- 基于溶剂进行明确的溶剂或分子动力学模拟
- 为蛋白质结构添加隐含膜,以便您可以基于场强制定模拟模型。
- 使用基于CHARMm的对接引擎CDOCKER来执行基于配体的配体结合和精炼对接。
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- 本文标签BIOVIA , Discovery Studio , 分子对接
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